1988 yılında genç bir delikanlı olan Donnie Darko, bir gece garip bir yaratık tarafından odasından alınarak sırra doğru sürüklenir.Yaratık Donnie'ye 28 gün, 6 saat, 42 dakika sonra kıyamet kopacağını ve dünyanın yok olacağını söyler.Olayın şokunu atlatamayan genç adam tüm sosyal yaşantısını sonlandırarak bu yaratığın peşinden gitmeye karar verir.